Eesti Keskkonnaobservatooriumis tehtavad pikaajalised mõõtmised on olulised mere, atmosfääri ja ökosüsteemi tervise mõistmiseks, paljastades mustreid ja muutusi, mida lühiajalised vaatlused ei suuda alati tabada. Pikaajalised ja mitmekesised andmekogumid võimaldavad meil tuvastada järkjärgulisi suundumusi, nagu merekeskkonna muutused, kasvuhoonegaaside kontsentratsiooni tõus või bioloogilise mitmekesisuse vähenemine. Samuti aitavad need eristada looduslikku varieeruvust – näiteks hooajalisi tsükleid või nähtusi – inimtegevusest tingitud mõjudest.
Pikaaegne seire loob aluse keskkonnapoliitika tõhususe hindamiseks ja toetab tulevaste tingimuste täpset prognoosimist. Lisaks võivad pikaajalised andmed olla varajase hoiatamise süsteemiks, mis annab märku kriitilistest ökosüsteemi nihketest enne lävede ületamist. Ilma pikaajaliste keskkonna mõõtmisteta riskime lühiajaliste andmete valesti tõlgendamisega ja meie elukeskkonna tervist kujundavate sügavamate muutuste tähelepanuta jätmisega.
Eesti keskkonnaobservatooriumi tiim korraldab igal aastal aastakonverentsi, et arutada uusimate teadussaavutuste üle ning parandada diskussiooni teadlaskonna ja otsustajate vahel.